El Fondo Ernesto Lemoine Villicaña se compone principalmente por Documentación del periodo de la Guerra de Independencia (1810-1821) trasncrita en su mayoría de manera mecanuscrita a partir de diferentes fondos del Archivo General de la Nación, principalmente los de Operaciones de Guerra y Confidencias, ya que gran parte de la misma la utilizó para confeccionar el borrador del libro "La última expedición de Morelos" (ICA, 2015), borrador que también se resguarda junto a las fchas de trabajo.