Fondo personal del músico mexicano, reconocido por melodías que marcaron el ámbito cultural no solo del país sino internacionalmente, entre ellas la famosa Estrellita. Se encuentra conformado por las secciones Documental, Fotográfica, Biblioteca y Objetos personales y muebles con un total de 1497 piezas.
La primera de ellas consta de 454 documentos con fechas extremas de 1899 hasta 1984, que a su vez se encuentran divididos en las siguientes series: Carteles, Cuadernos, Concurso Internacional de Guitarra Clásica, Dibujos, Diplomas, Discos Ángel, Documentos personales, Documentos de María Refugio Ponce, Folletos, Invitaciones, Partituras (con sus sub-series de Partituras de Cuquita y las de Manuel M. Ponce) y Recortes.
La sección Fotográfica contiene 3 álbumes, 20 fotografías sueltas y otras que se hallan enmarcadas, dando un total de 684 piezas. En cuanto a la temática de estas, cabe resaltar que se tratan de un fiel reflejo del ámbito artístico de principios del siglo XX.
La sección de Biblioteca tiene un repertorio de 178 libros, en el que el ejemplar más antiguo es del año 1818 y el más reciente de 1982, mientras que la sección de Hemeroteca está integrada por 54 ejemplares de revistas. Por último, La sección contiene 127 objetos dentro de los cuales hay dos subseries: objetos personales (110) y muebles (17). En la primera de esta se encuentran algunas pertenencias tanto de él como de su esposa Clema. Mientras que sobre los muebles se cuenta con sillas, un sillón, una mecedora, un escritorio, un carro de servicio, mesas, entre otros.